Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pramef8Q8CE24 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Pramef8Q8CE24 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms