Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms