Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms