Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccser1Q8C0C4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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