Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp38Q8BW70 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp38Q8BW70 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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