Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Atg4bQ8BGE6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.3 ms