Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ChfrQ810L3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ChfrQ810L3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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ChfrQ810L3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms