Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Dsg1cQ7TSF0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms