Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynmQ70IV5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynmQ70IV5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms