Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih3Q6ZWS4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms