Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ssxb3Q6XAS4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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