Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms