Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmeff1Q6PFE7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmeff1Q6PFE7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms