Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Usp49Q6P9L4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp49Q6P9L4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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