Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tpm4Q6IRU2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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