Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tbr1Q64336 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms