Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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