Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf6Q62311 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Taf6Q62311 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Taf6Q62311 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Taf6Q62311 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Taf6Q62311 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Taf6Q62311 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Taf6Q62311 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Taf6Q62311 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Taf6Q62311 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Taf6Q62311 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.9 ms