Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gli3Q61602 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gli3Q61602 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms