Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sox17Q61473 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sox17Q61473 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox17Q61473 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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