Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccne1Q61457 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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