Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BcanQ61361 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BcanQ61361 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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BcanQ61361 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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