Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tnfsf15Q5UBV8 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms