Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lrrc43Q3V0L5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lrrc43Q3V0L5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lrrc43Q3V0L5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrc43Q3V0L5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrc43Q3V0L5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrc43Q3V0L5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc43Q3V0L5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrc43Q3V0L5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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