Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gm27235Q3UW50 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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Gm27235Q3UW50 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Gm27235Q3UW50 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm27235Q3UW50 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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