Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ctsll3Q3ULP7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms