Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Puf60Q3UEB3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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