Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Ssbp4Q3U4B1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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