Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Col24a1Q30D77 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Col24a1Q30D77 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Col24a1Q30D77 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col24a1Q30D77 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col24a1Q30D77 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col24a1Q30D77 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col24a1Q30D77 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms