Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Samd11Q1RNF8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Samd11Q1RNF8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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