Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VgfQ0VGU4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms