Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms