Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AV039307-201ENSMUST00000124795 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm18200-201ENSMUST00000173265 833 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm18190-201ENSMUST00000174801 832 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms