Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms