Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Itga4Q00651 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Itga4Q00651 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms