Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Apoa1Q00623 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms