Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms