Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Smn1P97801 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Smn1P97801 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smn1P97801 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms