Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf1bP97358 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Taf1bP97358 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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