Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.8 ms