Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SbdsP70122 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms