Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
UbdP63072 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
UbdP63072 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
UbdP63072 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms