Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Rps6ka1-205ENSMUST00000157067 2637 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Sh3bgrl2-204ENSMUST00000188241 3155 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm5281-201ENSMUST00000197542 2134 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 4930525C09Rik-201ENSMUST00000217919 677 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Prkar1a-203ENSMUST00000106677 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Unc45b-201ENSMUST00000018989 3549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 AC155941.2-201ENSMUST00000218795 1861 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 AC167565.2-201ENSMUST00000227042 1870 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Garnl3-207ENSMUST00000137381 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Cd200-202ENSMUST00000163230 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Nek10-202ENSMUST00000112630 3348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm28177-201ENSMUST00000185516 3532 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Bag3-201ENSMUST00000033136 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Dgka-201ENSMUST00000026414 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Aasdh-202ENSMUST00000120963 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rps28P62858 Ccdc120-201ENSMUST00000033490 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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