Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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CartptP56388 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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CartptP56388 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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CartptP56388 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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CartptP56388 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CartptP56388 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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CartptP56388 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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CartptP56388 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CartptP56388 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CartptP56388 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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CartptP56388 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CartptP56388 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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CartptP56388 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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CartptP56388 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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CartptP56388 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CartptP56388 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms