Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms