Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtpreP49446 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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