Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms