Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gbx2P48031 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms