Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf5P43027 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf5P43027 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms