Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Apoc1P34928 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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